|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
20/07/2021 |
Data da última atualização: |
20/07/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KIWUKA, C.; GOUDSMIT, E.; TOURNEBIZE, R.; AQUINO, S. O. de; DOUMA, J. C.; BELLANGER, L.; CROUZILLAT, D.; STOFFELEN, P.; SUMIRAT, U.; LEGNATÉ, H.; MARRACCINI, P.; KOCHKO, A. de; ANDRADE, A. C.; MULUMBA, J. W.; MUSOLI, P.; ANTEN, N. P. R.; PONCET, V. |
Afiliação: |
CATHERINE KIWUKA, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; EVA GOUDSMIT, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; RÉMI TOURNEBIZE, UNIV. MONTPELLIER - CIRAD; SINARA OLIVEIRA DE AQUINO, UNIV. MONTPELLIER - CIRAD; JACOB C. DOUMA, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; LAURENCE BELLANGER, NESTLÉ RESEARCH; DOMINIQUE CROUZILLAT, NESTLÉ RESEARCH; PIET STOFFELEN, MEISE BOTANIC GARDEN; UCU SUMIRAT, ICCRI; HYACINTHE LEGNATÉ, CNRA; PIERRE MARRACCINI, UNIV. MONTPELLIER; ALEXANDRE DE KOCHKO, UNIV. MONTPELLIER; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCa; JOHN WASSWA MULUMBA, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; PASCAL MUSOLI, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; NIELS P. R. ANTEN, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; VALÉRIE PONCET, UNIV. MONTPELLIER - CIRAD. |
Título: |
Genetic diversity of native and cultivated Ugandan Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner): Climate influences, breeding potential and diversity conservation. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 16, n. 2, p. e0245965, 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0245965 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Wild genetic resources and their ability to adapt to environmental change are critically important in light of the projected climate change, while constituting the foundation of agricultural sustainability. To address the expected negative effects of climate change on Robusta coffee trees (Coffea canephora), collecting missions were conducted to explore its current native distribution in Uganda over a broad climatic range. Wild material from seven forests could thus be collected. We used 19 microsatellite (SSR) markers to assess genetic diversity and structure of this material as well as material from two ex-situ collections and a feral population. The Ugandan C. canephora diversity was then positioned relative to the species? global diversity structure. Twenty-two climatic variables were used to explore variations in climatic zones across the sampled forests. Overall, Uganda's native C. canephora diversity differs from other known genetic groups of this species. In northwestern (NW) Uganda, four distinct genetic clusters were distinguished being from Zoka, Budongo, Itwara and Kibale forests A large southern-central (SC) cluster included Malabigambo, Mabira, and Kalangala forest accessions, as well as feral and cultivated accessions, suggesting similarity in genetic origin and strong gene flow between wild and cultivated compartments. We also confirmed the introduction of Congolese varieties into the SC region where most Robusta coffee production takes place. Identified populations occurred in divergent environmental conditions and 12 environmental variables significantly explained 16.3% of the total allelic variation across populations. The substantial genetic variation within and between Ugandan populations with different climatic envelopes might contain adaptive diversity to cope with climate change. The accessions that we collected have substantially enriched the diversity hosted in the Ugandan collections and thus contribute to ex situ conservation of this vital genetic resource. However, there is an urgent need to develop strategies to enhance complementary in-situ conservation of Coffea canephora in native forests in northwestern Uganda. MenosWild genetic resources and their ability to adapt to environmental change are critically important in light of the projected climate change, while constituting the foundation of agricultural sustainability. To address the expected negative effects of climate change on Robusta coffee trees (Coffea canephora), collecting missions were conducted to explore its current native distribution in Uganda over a broad climatic range. Wild material from seven forests could thus be collected. We used 19 microsatellite (SSR) markers to assess genetic diversity and structure of this material as well as material from two ex-situ collections and a feral population. The Ugandan C. canephora diversity was then positioned relative to the species? global diversity structure. Twenty-two climatic variables were used to explore variations in climatic zones across the sampled forests. Overall, Uganda's native C. canephora diversity differs from other known genetic groups of this species. In northwestern (NW) Uganda, four distinct genetic clusters were distinguished being from Zoka, Budongo, Itwara and Kibale forests A large southern-central (SC) cluster included Malabigambo, Mabira, and Kalangala forest accessions, as well as feral and cultivated accessions, suggesting similarity in genetic origin and strong gene flow between wild and cultivated compartments. We also confirmed the introduction of Congolese varieties into the SC region where most Robusta coffee production takes place. Identified popu... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Coffea Canephora; Genética Vegetal; Mudança Climática; Variação Genética; Variedade. |
Thesaurus Nal: |
Climate change; Coffea canephora var. ugandae; Genetic variation. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224555/1/Genetic-diversity-of-native.pdf
|
Marc: |
LEADER 03463naa a2200421 a 4500 001 2133040 005 2021-07-20 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0245965$2DOI 100 1 $aKIWUKA, C. 245 $aGenetic diversity of native and cultivated Ugandan Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner)$bClimate influences, breeding potential and diversity conservation.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aWild genetic resources and their ability to adapt to environmental change are critically important in light of the projected climate change, while constituting the foundation of agricultural sustainability. To address the expected negative effects of climate change on Robusta coffee trees (Coffea canephora), collecting missions were conducted to explore its current native distribution in Uganda over a broad climatic range. Wild material from seven forests could thus be collected. We used 19 microsatellite (SSR) markers to assess genetic diversity and structure of this material as well as material from two ex-situ collections and a feral population. The Ugandan C. canephora diversity was then positioned relative to the species? global diversity structure. Twenty-two climatic variables were used to explore variations in climatic zones across the sampled forests. Overall, Uganda's native C. canephora diversity differs from other known genetic groups of this species. In northwestern (NW) Uganda, four distinct genetic clusters were distinguished being from Zoka, Budongo, Itwara and Kibale forests A large southern-central (SC) cluster included Malabigambo, Mabira, and Kalangala forest accessions, as well as feral and cultivated accessions, suggesting similarity in genetic origin and strong gene flow between wild and cultivated compartments. We also confirmed the introduction of Congolese varieties into the SC region where most Robusta coffee production takes place. Identified populations occurred in divergent environmental conditions and 12 environmental variables significantly explained 16.3% of the total allelic variation across populations. The substantial genetic variation within and between Ugandan populations with different climatic envelopes might contain adaptive diversity to cope with climate change. The accessions that we collected have substantially enriched the diversity hosted in the Ugandan collections and thus contribute to ex situ conservation of this vital genetic resource. However, there is an urgent need to develop strategies to enhance complementary in-situ conservation of Coffea canephora in native forests in northwestern Uganda. 650 $aClimate change 650 $aCoffea canephora var. ugandae 650 $aGenetic variation 650 $aCoffea Canephora 650 $aGenética Vegetal 650 $aMudança Climática 650 $aVariação Genética 650 $aVariedade 700 1 $aGOUDSMIT, E. 700 1 $aTOURNEBIZE, R. 700 1 $aAQUINO, S. O. de 700 1 $aDOUMA, J. C. 700 1 $aBELLANGER, L. 700 1 $aCROUZILLAT, D. 700 1 $aSTOFFELEN, P. 700 1 $aSUMIRAT, U. 700 1 $aLEGNATÉ, H. 700 1 $aMARRACCINI, P. 700 1 $aKOCHKO, A. de 700 1 $aANDRADE, A. C. 700 1 $aMULUMBA, J. W. 700 1 $aMUSOLI, P. 700 1 $aANTEN, N. P. R. 700 1 $aPONCET, V. 773 $tPlos One$gv. 16, n. 2, p. e0245965, 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
26/07/2016 |
Data da última atualização: |
26/07/2016 |
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
Autoria: |
CRUZ NETO, A. J. da. |
Afiliação: |
ALIRIO JOSÉ DA CRUZ NETO, UEFS. |
Título: |
Parâmetros genéticos e estudo de adaptabilidade, estabilidade em híbridos de maracujazeiro-amarelo. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
CRUZ NETO, A. J. da. Parâmetros genéticos e estudo de adaptabilidade, estabilidade em híbridos de maracujazeiro-amarelo. 2016. 65 f. il. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Feira de Santana, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, 2016. Orientadora: Prof.ª Drª. Adriana Rodrigues Passos; Coorientador: Dr. Onildo Nunes de Jesus (EMBRAPA/CNPMF). |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Orientadora: Prof.ª Drª. Adriana Rodrigues Passos; Coorientador: Dr. Onildo Nunes de Jesus (EMBRAPA/CNPMF). |
Conteúdo: |
Os objetivos deste trabalho foram avaliar a adaptabilidade e estabilidade de 14 híbridos de maracujazeiro-amarelo, estimar os componentes genéticos de variância e de média via modelos mistos (REML/BLUP), estabelecer as correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais entre características do fruto de maracujazeiro em três ambientes. Foram avaliados 14 genótipos de maracujazeiro nos ambientes de Dom Basílio-BA, Rio de Contas-BA e Lençóis-BA, utilizando o delineamento experimental em blocos casualizados completos, com três repetições e nove plantas por parcela. A seleção genótipos baseou-se nos métodos da adaptabilidade dada pela média harmônica dos valores genéticos (MHVG), estabilidade pela performance relativa dos valores genéticos (PRVG) e seleção conjunta para adaptabilidade e estabilidade dada pela média harmônica da performance relativa dos valores genéticos (MHPRVG). Foram estimadas as correlação genotípica (rG), fenotípica (rF) e de ambiente (rE) para cada ambiente. Foram avaliados os caracteres, número de frutos (NF); produtividade total acumulada (PR); massa do fruto (MF); comprimento de frutos (CF); diâmetro do fruto (DF); relação CF/DF; massa da casca (MC); espessura de casca (EC); massa da polpa (MP); rendimento de suco (RE); sólidos solúveis (SS); acidez titulável (AT) e RATIO (SS/AT). As estimativas de herdabilidade e os ganhos genéticos nos ambientes avaliados apresentaram boas perspectivas para seleção de genótipos superiores. Houve efeito pronunciado da interação GxE para a maioria dos caracteres, exceto CF, RE, SS, AT e SS/AT. De acordo com o critério MHPRVG os híbridos mais estáveis e adaptáveis nos ambientes de avaliação foram o BRS Gigante Amarelo, HFOP-09, H09-09, GP09-02, GP09-03 e BRS Sol do Cerrado. Em 88,88% dos casos as estimativas das correlações genotípicas foram maiores do que as fenotípicas nos três ambientes. Em lençóis as correlações genotípicas foram negativas entre NF x MF, DF, EC, MC, MP, SS e AT, divergindo dos demais ambientes. Nos ambientes de Dom Basílio e Rio de Contas a PR correlacionou se positivamente com MF, CF, DF e MC. Em todos os ambientes a seleção de frutos com maiores MF proporcionará maiores CF, DF, PC e PP e pela seleção do formato de frutos ovais menor espessura de casca. De modo geral, para as correlações entre características de importância agronômica, como NF x PR, SS; MF x DF, MC, MP, RATIO; DF x MC, MP, RATIO; CF/DF x EC e MC x RATIO apresentaram o mesmo comportamento nos três ambientes de avaliação, exceto para características NF x MF, DF, EC, MC, MP e AT em Lençóis. MenosOs objetivos deste trabalho foram avaliar a adaptabilidade e estabilidade de 14 híbridos de maracujazeiro-amarelo, estimar os componentes genéticos de variância e de média via modelos mistos (REML/BLUP), estabelecer as correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais entre características do fruto de maracujazeiro em três ambientes. Foram avaliados 14 genótipos de maracujazeiro nos ambientes de Dom Basílio-BA, Rio de Contas-BA e Lençóis-BA, utilizando o delineamento experimental em blocos casualizados completos, com três repetições e nove plantas por parcela. A seleção genótipos baseou-se nos métodos da adaptabilidade dada pela média harmônica dos valores genéticos (MHVG), estabilidade pela performance relativa dos valores genéticos (PRVG) e seleção conjunta para adaptabilidade e estabilidade dada pela média harmônica da performance relativa dos valores genéticos (MHPRVG). Foram estimadas as correlação genotípica (rG), fenotípica (rF) e de ambiente (rE) para cada ambiente. Foram avaliados os caracteres, número de frutos (NF); produtividade total acumulada (PR); massa do fruto (MF); comprimento de frutos (CF); diâmetro do fruto (DF); relação CF/DF; massa da casca (MC); espessura de casca (EC); massa da polpa (MP); rendimento de suco (RE); sólidos solúveis (SS); acidez titulável (AT) e RATIO (SS/AT). As estimativas de herdabilidade e os ganhos genéticos nos ambientes avaliados apresentaram boas perspectivas para seleção de genótipos superiores. Houve efeito pronunciado da int... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Passiflora edulis f flavicarpa. |
Thesagro: |
Maracujá. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 03578nam a2200145 a 4500 001 2049675 005 2016-07-26 008 2016 bl uuuu m 00u1 u #d 100 1 $aCRUZ NETO, A. J. da 245 $aParâmetros genéticos e estudo de adaptabilidade, estabilidade em híbridos de maracujazeiro-amarelo.$h[electronic resource] 260 $aCRUZ NETO, A. J. da. Parâmetros genéticos e estudo de adaptabilidade, estabilidade em híbridos de maracujazeiro-amarelo. 2016. 65 f. il. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Feira de Santana, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, 2016. Orientadora: Prof.ª Drª. Adriana Rodrigues Passos; Coorientador: Dr. Onildo Nunes de Jesus (EMBRAPA/CNPMF).$c2016 500 $aOrientadora: Prof.ª Drª. Adriana Rodrigues Passos; Coorientador: Dr. Onildo Nunes de Jesus (EMBRAPA/CNPMF). 520 $aOs objetivos deste trabalho foram avaliar a adaptabilidade e estabilidade de 14 híbridos de maracujazeiro-amarelo, estimar os componentes genéticos de variância e de média via modelos mistos (REML/BLUP), estabelecer as correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais entre características do fruto de maracujazeiro em três ambientes. Foram avaliados 14 genótipos de maracujazeiro nos ambientes de Dom Basílio-BA, Rio de Contas-BA e Lençóis-BA, utilizando o delineamento experimental em blocos casualizados completos, com três repetições e nove plantas por parcela. A seleção genótipos baseou-se nos métodos da adaptabilidade dada pela média harmônica dos valores genéticos (MHVG), estabilidade pela performance relativa dos valores genéticos (PRVG) e seleção conjunta para adaptabilidade e estabilidade dada pela média harmônica da performance relativa dos valores genéticos (MHPRVG). Foram estimadas as correlação genotípica (rG), fenotípica (rF) e de ambiente (rE) para cada ambiente. Foram avaliados os caracteres, número de frutos (NF); produtividade total acumulada (PR); massa do fruto (MF); comprimento de frutos (CF); diâmetro do fruto (DF); relação CF/DF; massa da casca (MC); espessura de casca (EC); massa da polpa (MP); rendimento de suco (RE); sólidos solúveis (SS); acidez titulável (AT) e RATIO (SS/AT). As estimativas de herdabilidade e os ganhos genéticos nos ambientes avaliados apresentaram boas perspectivas para seleção de genótipos superiores. Houve efeito pronunciado da interação GxE para a maioria dos caracteres, exceto CF, RE, SS, AT e SS/AT. De acordo com o critério MHPRVG os híbridos mais estáveis e adaptáveis nos ambientes de avaliação foram o BRS Gigante Amarelo, HFOP-09, H09-09, GP09-02, GP09-03 e BRS Sol do Cerrado. Em 88,88% dos casos as estimativas das correlações genotípicas foram maiores do que as fenotípicas nos três ambientes. Em lençóis as correlações genotípicas foram negativas entre NF x MF, DF, EC, MC, MP, SS e AT, divergindo dos demais ambientes. Nos ambientes de Dom Basílio e Rio de Contas a PR correlacionou se positivamente com MF, CF, DF e MC. Em todos os ambientes a seleção de frutos com maiores MF proporcionará maiores CF, DF, PC e PP e pela seleção do formato de frutos ovais menor espessura de casca. De modo geral, para as correlações entre características de importância agronômica, como NF x PR, SS; MF x DF, MC, MP, RATIO; DF x MC, MP, RATIO; CF/DF x EC e MC x RATIO apresentaram o mesmo comportamento nos três ambientes de avaliação, exceto para características NF x MF, DF, EC, MC, MP e AT em Lençóis. 650 $aMaracujá 653 $aPassiflora edulis f flavicarpa
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|